1.根据造血干细胞的来源分为：骨髓移植、外周血干细胞移植、脐带血干细胞移植、胎肝细胞移植。

2.根据免疫学分类：自体造血干细胞移植（干细胞来源于自身）、同基因造血干细胞移植（供受者为同卵双生的双胞胎）、异基因造血干细胞移植（干细胞来源于非同卵双生的其他人）、异种造血干细胞移植（干细胞来源于其他物种，比如说，猪）。

3.根据亲缘关系分类：亲缘性造血干细胞移植（干细胞来源于与受者有亲缘关系的人，如父母、兄弟姐妹、子女）、非亲缘性造血干细胞移植（干细胞来源于与受者无亲缘关系的人）。