除一些化学因素和物理因素、生物因素、遗传因素可导致再生障碍性贫血外，有些疾病往往在其演变的过程中也可导致再生障碍性贫血的发生。

长期未经治疗的各种贫血、慢性肾功能衰竭、垂体前叶及甲状腺机能减退症、免疫因素、遗传因素均能引起再障，部分阵发性睡眠性血红蛋白尿症（PNH）也可转化为再障，称“AA-PNH综合征”。少数女性再障，在妊娠期发病，分娩后缓解，第二次妊娠复发。遗传病如 综合征、先天性角质分化不良等，由于DNA的修复障碍，或免疫缺损，易伴发再障。