骨髓的微环境包括微循环和基质，骨髓造血和骨髓微环境有密切关系。再障患者骨髓活检的组织切片中可见毛细血管较少，血流量降低，间质有水肿，造血微环境有病变。

骨髓细胞体外长期培养需要骨髓基质细胞和细胞外基质构成的网络，为造血干细胞提供适宜的生长微环境。国内外学者给大鼠和小鼠作局部致死量照射，造成局部骨髓脂肪化模型，在骨髓脂肪化过程中，均有暂时恢复的现象。说明动物再障的发病是由于造血微环境的障碍。

在有再障患者血清雄激素水平、白介素-1低于正常人，IL-2、SIL-2R、可溶性CD抗原及干扰素高于正常人等。